严格执行“一人、一水、一圈、一消毒”原则，婴儿游泳时，一名婴儿只允许留一名陪护人（无感染性疾病者）观看，陪护人要听工作人员的管理，非工作人员及非允许的陪护人不得进入游泳室。婴儿游泳区应分为感染区和非感染区，患有传染病的婴幼儿单独隔离，避免交叉感染，患有严重皮肤病、先天性心脏病的孩子不能游。

婴儿游泳馆注意通风问题。婴儿游泳馆因为潮湿以及保温的需求在装修时密封较严,这样一来婴儿游泳馆在开业一段时间之后往往就会产生霉渍和异味等等味道。所以在婴儿游泳馆较初的装修中,就要合理的安排出良好的通风设施,以便于经常地排出潮湿空气和不洁空气,换进新鲜的空气。就算是在寒冷的冬季也应该确保婴儿游泳馆的及时换气。小电器应安装在远离婴儿游泳池的地方,以防万一开动的电器掉下来,造成致命的危险。婴儿游泳馆内需要确保空气和婴儿游泳馆的附加设施没有交叉污染的可能。